المادة 26 من قانون المناطق الاقتصادية 83/2002

تتولى الإشراف على تطبيق النظام الضريبي الخاص بالمنطقة لجنة عليا للضرائب يصدر بتشكيلها وقواعد وإجراءات العمل بها قرار من رئيس الهيئة بعد موافقة وزير المالية، وتضم: ( أ ) ممثلاً لوزارة المالية رئيسًا (ب) ممثلاً لمصلحة الضرائب على الدخل عضوًا (ج) ممثلاً للجهاز المركزي للمحاسبات عضوًا (د) المدير التنفيذي لضرائب المنطقة عضوًا (ه) أربعة أعضاء من العاملين بمهنة مراقبة الحسابات في مصر. وتختص اللجنة بالإشراف على تنفيذ الأنظمة الضرائبية الخاصة بالمنطقة وعلى تنفيذ السياسات والقرارات التي يصدرها مجلس إدارة الهيئة أو رئيس الهيئة، ومتابعة وتطبيق ما يتم من تطوير في أنظمة التحصيل. كما تختص اللجنة بوضع الشروط التي يجب أن تستوفيها الشركات والمنشآت والفروع بما في ذلك الالتزام بنظم الضبط والرقابة الداخلية، وبتطبيق معايير المحاسبة المصرية أو المعايير العالمية فيما لم يرد به نص في المعايير المصرية، وإمساك الدفاتر التي يصدر بتحديدها قرار من اللجنة، واعتماد ميزانيتها من أحد مراقبي الحسابات المقيدين لدى الهيئة.